Wednesday, November 22, 2006

Some more biological equipment:

During the last three days we have learned a lot about using mass spectrometry for Proteomics for example deriving the amino acid sequence of a peptide from some spectras. In general a mass spectrometer a balance for molecules which can measure very small masses very exactly. Today were some demonstrations and that was the first instrument we saw: a big coffin.
Heute gibts nen bisschen mehr biologische Ausüstunggsgegenstände: In den letzten drei Tagen haben wir recht viel über Massenspektrometrie für Proteomics gelernt, unter Anderem wie man die Aminosäuresequenz eines Peptids aus Spektren ableiten kann. Vereinfacht gesagt ist ein Massenspektrometer eine "Waage" für Moleküle, die sehr kleine Massen sehr genau bestimmt. Heute war Demonstration angesagt und wir haben erstmal diesen großen Sarg gesehen:
This coffin is called Maldi-TOFTOF. Maldi is the Ion making system, Proteins are in a Matrix and a Laserbeam pushes the Ions out of this matrix. The Ions then fly through a long, empty tube and all the rest this machine does is measuring the time until the Ions come to the end of the tube. Small ions are faster than big ones.
Diesen Sarg nennt man Maldi-TOFTOF. Maldi ist die Art mit der die Ionen erzeugt werden, die Proteine sind in eine Matrix eingebettet aus der mit Hilfe eines Lasers die Proteine als Ionen freigesetzt werden. Anschließend fliegen die Ionen durch ein langes leeres Rohr, und alles was das Gerät dann noch macht ist die Zeit messen bis die Proteine am Ende des Rohres ankommen. Kleine Ionen sind dabei schneller als große.
This is the inside of the machine: the black-silver box on top contains the Laser
Das ist das Innenleben des Sargs: der kleine schwarz-silberne Kasten oben beinhaltet den Laser

That is the long, empty tube:
Das ist das lange, leere Rohr:



Thats a sample-plate. every circle contains one protein in the matrix
Das ist eine Probenplatte, jeder Kreis beinhaltet ein Protein eingebettet in die Matrix


And that is how the results look like: lots of lines and numbers:
Und so sieht dann das Ergebnis aus: viele Linien und Zahlen:
We also saw another machine which works with different systems but the outside looks very similar. In general this seems to be a very useful technique, but you pay half a million punds for a Laser, a long, empty tube, a detector and a clock.
Wir haben auch noch eine andere Maschine gesehen, die mit etwas anderer Technik arbeitet, aber von außen sieht sie sehr ähnlich aus. Es scheint eine recht nützliche Technik zu sein, allerdings bezahlt man eine halbe Million für einen Laser, ein langes, leeres Rohr, einen Detektor und eine Uhr.




No comments: